本项目结合我国胃癌的发病特点和疾病类型,建立胃癌生物样本搜集的统一质控标准,以多重组学 (包括原发以及转移后转录组学、基因组学、蛋白组学、肠道微生物组学,临床真实世界大数据)大数据为基础,结合生物信息学分析及基于深度学习为基础的人工智能分析,建立高精度识别胃癌致病和转移相关基因以及表观遗传信息的新方法,通过精准分子分型对胃癌的治疗提供个性化方案,并通过大数据共享云平台建立综合性胃癌风险评估,精准治疗和规范化临床应用分析报告系统,造福于胃癌患者。基于我国大样本胃癌的生命组学大数据,研发高精度识别胃癌致病和转移相关基因以及表观遗传信息的新技术、新方法;绘制胃癌各类亚型特异的遗传与表观遗传特征图,并验证胃癌基因分子分型;研究各亚型特异的分子与临床表征及复发转移机制,筛选可用于临床精准诊疗的特异性分子标志物及药物靶点;构建胃癌精准诊疗的全链条技术体系,开发规范化的临床应用分析系统。
研究重点:
(1)建立胃癌生物样本搜集的统一质控标准和入组标准,完善整合高度统一的生物资源大样本库;
(2)搭建大数据存储、传输、分析、共享及个性化诊疗决策与评价的网络云平台;
(3)确定高精而敏感的胃癌分子分型标准,绘制各类胃癌亚型特异的遗传与表观遗传特征图谱;
(4)构建胃癌精准诊疗的全链条技术体系,开发规范化的临床应用分析系统。
针对胃癌患者的大样本系统性精准分子分型研究,胃癌严重危害我国人民健康,据国家癌症中心主任赫捷院士“2017年最新中国肿瘤现状和趋势报告”提示:其发病率居男性癌症第二位和女性第四位;而死亡率均为男性和女性癌症第二位;且具年轻化趋势,多发于35-55岁年龄组。我国胃癌患者的5年相对生存率仅为27%,与胃癌病因的多样性、基因组及表现型的异质性、表观遗传修饰的可逆性所导致的高转移性、高突变性、抗药性,以及治疗手段的单一性密切相关。针对胃癌患者的大样本系统性精准分子分型研究还没有。如何高效应用多重组学大数据进行整合和挖掘是胃癌精准诊疗的关键,具有现实的紧迫性。